Comparar cèl·lules d'una esponja marina i d'un cuc rodó no és fàcil: els gens són diferents i els organismes es van separar fa més de mil milions d'anys. Un equip de Stanford ha entrenat un model d'IA per fer-ho, i el treball s'ha explicat en dos articles, a Nature i a Science, segons la nota de Stanford Medicine.
El model, TranscriptFormer, és una segona generació d'un primer model d'incrustació universal de cèl·lules. Es va entrenar amb 112 milions de cèl·lules de dotze espècies, entre elles humans, ratolins, peixos zebra, mosques del vinagre, llevats, esponges i el paràsit de la malària. Aprèn a predir dades d'expressió gènica que falten i, així, construeix un «espai matemàtic» on es poden mesurar les relacions entre cèl·lules de qualsevol organisme.
Els autors expliquen que el sistema ja ha resolt preguntes obertes de biologia: per exemple, va mostrar que els coanòcits de les esponges s'assemblen més a neurones de cucs rodons i de granotes que no pas a les cèl·lules que se'ls considerava afins. També identifica tipus de cèl·lules en espècies que no ha vist durant l'entrenament i distingeix les sanes de les malaltes. El dirigeixen Stephen Quake i Jure Leskovec, de Stanford, i Theo Karaletsos, de la Chan Zuckerberg Initiative.
Cal llegir-ho com a eina de recerca, no com un veredicte: la nota de premsa dona pocs detalls de mesura i no quantifica la precisió. Que el model «dibuixi» relacions evolutives no les demostra per si sol; són hipòtesis que els biòlegs hauran de confirmar al laboratori. El treball es va publicar el setembre; el recollim ara perquè l'edició no l'havia tractat.